More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3109 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.83 
 
 		 4336 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  30.62 
 
 		 1753 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.53 
 
 		 4336 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.96 
 
 		 2791 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  100 
 
 		 1981 aa  3877    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  33.31 
 
 		 1789 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.26 
 
 		 6403 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  32.47 
 
 		 2721 aa  622  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32 
 
 		 1776 aa  619  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.58 
 
 		 4342 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.39 
 
 		 4318 aa  612  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.47 
 
 		 4332 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.06 
 
 		 4342 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.4 
 
 		 4317 aa  603  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  29.8 
 
 		 2997 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.11 
 
 		 3231 aa  592  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.38 
 
 		 4317 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.78 
 
 		 4317 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  30.89 
 
 		 1801 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.73 
 
 		 4317 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 		 2820 aa  573  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 		 1779 aa  566  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  32.49 
 
 		 3208 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  31.46 
 
 		 3235 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  28.08 
 
 		 4531 aa  434  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  25.31 
 
 		 3235 aa  429  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  33.79 
 
 		 2250 aa  429  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  26.45 
 
 		 7122 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  28.98 
 
 		 6676 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  29.15 
 
 		 8646 aa  397  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  26.27 
 
 		 4968 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  29.52 
 
 		 8914 aa  390  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  25.34 
 
 		 2753 aa  390  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  24.71 
 
 		 2156 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  25.78 
 
 		 4960 aa  384  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 		 1656 aa  384  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  28.58 
 
 		 5953 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.47 
 
 		 6889 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.03 
 
 		 3432 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  26.09 
 
 		 4960 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.36 
 
 		 1067 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  26.59 
 
 		 2571 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  26.59 
 
 		 2571 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 725 aa  377  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 725 aa  377  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  24.54 
 
 		 2156 aa  373  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  24.9 
 
 		 2156 aa  370  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  29.25 
 
 		 3331 aa  371  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  28.86 
 
 		 2370 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  28.53 
 
 		 2137 aa  367  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  27.72 
 
 		 3176 aa  367  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.28 
 
 		 5328 aa  366  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 1474 aa  363  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  29.55 
 
 		 5149 aa  363  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.3 
 
 		 2385 aa  362  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  24.33 
 
 		 3291 aa  360  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  27.13 
 
 		 2448 aa  358  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  30.42 
 
 		 8211 aa  358  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.4 
 
 		 2762 aa  358  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 595 aa  358  7.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  27.09 
 
 		 5596 aa  357  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  29.06 
 
 		 5926 aa  355  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  27.49 
 
 		 9498 aa  355  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  26.84 
 
 		 3308 aa  353  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  27.14 
 
 		 13537 aa  352  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  29.01 
 
 		 2125 aa  352  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  27.27 
 
 		 4502 aa  351  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  28.09 
 
 		 4383 aa  348  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  23.98 
 
 		 3086 aa  347  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 596 aa  346  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  23.88 
 
 		 3086 aa  346  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  27.3 
 
 		 3289 aa  345  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.49 
 
 		 1839 aa  344  9e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0188  amino acid adenylation domain-containing protein  27.56 
 
 		 1638 aa  344  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  25.01 
 
 		 2581 aa  343  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  26.68 
 
 		 2154 aa  342  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  25.45 
 
 		 1336 aa  342  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.71 
 
 		 2385 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  27.64 
 
 		 3348 aa  339  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 991 aa  338  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.53 
 
 		 2385 aa  338  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  24.28 
 
 		 2151 aa  338  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  27.88 
 
 		 3291 aa  336  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  27.7 
 
 		 5422 aa  337  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 608 aa  336  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  29 
 
 		 4882 aa  336  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  27.98 
 
 		 5620 aa  335  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  39.26 
 
 		 622 aa  334  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  27.75 
 
 		 5929 aa  333  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  26.86 
 
 		 2385 aa  333  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  28.32 
 
 		 6661 aa  333  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  26.85 
 
 		 6113 aa  333  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  26.2 
 
 		 2386 aa  333  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.94 
 
 		 2385 aa  333  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  25.82 
 
 		 2386 aa  332  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  27.73 
 
 		 7712 aa  332  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.5 
 
 		 7541 aa  332  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 610 aa  332  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 611 aa  331  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  27.65 
 
 		 3021 aa  331  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>