More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1931 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  55.15 
 
 
550 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  59.46 
 
 
556 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  62.75 
 
 
553 aa  726    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  60.22 
 
 
564 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  60.4 
 
 
551 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  58.95 
 
 
556 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.74 
 
 
557 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.33 
 
 
557 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  56.16 
 
 
544 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  54.22 
 
 
559 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  56.4 
 
 
552 aa  652    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  55.42 
 
 
550 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 
556 aa  1132    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  56.5 
 
 
550 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  59.39 
 
 
556 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.51 
 
 
544 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.12 
 
 
550 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  54.4 
 
 
559 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  56.32 
 
 
551 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.35 
 
 
556 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  52.87 
 
 
559 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  59.6 
 
 
543 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  58.84 
 
 
557 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  59.89 
 
 
556 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  57.22 
 
 
551 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  60.14 
 
 
557 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  57.43 
 
 
545 aa  652    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  57.81 
 
 
557 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  59.11 
 
 
556 aa  690    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  58.27 
 
 
552 aa  687    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  55.02 
 
 
553 aa  632  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  57.32 
 
 
556 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  57.32 
 
 
556 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  55.15 
 
 
550 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  53.5 
 
 
559 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  54.51 
 
 
552 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  55.81 
 
 
556 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  54.69 
 
 
552 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  54.43 
 
 
550 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  55.73 
 
 
555 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.71 
 
 
550 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  54.51 
 
 
552 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  53.21 
 
 
559 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  53.94 
 
 
553 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.97 
 
 
552 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.89 
 
 
552 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  52.86 
 
 
559 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  53.51 
 
 
553 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  53.94 
 
 
553 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  54.23 
 
 
558 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  54.51 
 
 
551 aa  621  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  54.25 
 
 
560 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  53.39 
 
 
559 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  54.97 
 
 
555 aa  621  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  53.21 
 
 
559 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  54.69 
 
 
552 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.21 
 
 
559 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  52.96 
 
 
559 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  54.25 
 
 
560 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  52.96 
 
 
589 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  53.21 
 
 
559 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.6 
 
 
559 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.6 
 
 
559 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.6 
 
 
559 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  52.6 
 
 
559 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  52.6 
 
 
559 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  53.62 
 
 
548 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  54.91 
 
 
669 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  54.59 
 
 
554 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.63 
 
 
557 aa  608  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  52.24 
 
 
589 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  55.42 
 
 
552 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51.9 
 
 
550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.2 
 
 
570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  52.8 
 
 
560 aa  601  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  51.71 
 
 
552 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  54.27 
 
 
569 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.46 
 
 
551 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  53.32 
 
 
553 aa  586  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  49.64 
 
 
561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1862  sulfite reductase oxidoreductase protein  53.71 
 
 
577 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816955  normal  0.207611 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  53.23 
 
 
568 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  49.91 
 
 
560 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  49.2 
 
 
561 aa  568  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.73 
 
 
551 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  51.44 
 
 
568 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4335  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.11 
 
 
593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321125  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1354  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component  50.34 
 
 
594 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  49.74 
 
 
605 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  49.25 
 
 
608 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5829  sulfite reductase (ferredoxin)  48.98 
 
 
596 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.635326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2408  Sulfite reductase (ferredoxin)  49.75 
 
 
592 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  48.83 
 
 
602 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4393  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.19 
 
 
594 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196691  normal  0.0835923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3929  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  51.02 
 
 
594 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  49.32 
 
 
596 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0922  putative nitrite/sulfite reductase  50.25 
 
 
595 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5807  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.83 
 
 
594 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1568  nitrite/sulfite reductase family protein  49.42 
 
 
729 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1466  sulfite reductase, beta subunit  49.42 
 
 
633 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>