41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1523 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1523  hemerythrin  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  28.87 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  28.87 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0987  hemerythrin-like metal-binding protein  26.87 
 
 		 151 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  25.3 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  36.05 
 
 		 631 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 		 518 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  25.98 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  32.52 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  26.02 
 
 		 147 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.51 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1660  hemerythrin HHE cation binding region  26.67 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 559 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  24.22 
 
 		 157 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  29.06 
 
 		 360 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 148 aa  45.8  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  30.53 
 
 		 137 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.71 
 
 		 662 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 		 518 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  24.39 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 994 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 		 1032 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1104  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  23.53 
 
 		 98 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 		 722 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0967  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.13 
 
 		 1004 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  30.65 
 
 		 596 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  31.06 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  27.73 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.12 
 
 		 530 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1744  metal-binding diguanylate cyclase domain-containing protein  24.79 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  31.4 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.98 
 
 		 779 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  27.27 
 
 		 183 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  26.89 
 
 		 135 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0275  diguanylate cyclase  31.09 
 
 		 630 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  26.23 
 
 		 160 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>