251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1279 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1279  asparagine synthase  100 
 
 
642 aa  1312    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0855  asparagine synthase  34.53 
 
 
644 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.434854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3028  asparagine synthase  30.89 
 
 
592 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0819  asparagine synthase  27.93 
 
 
653 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3241  asparagine synthase  27.05 
 
 
649 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3386  asparagine synthase  24.63 
 
 
645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.320391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2340  asparagine synthase  24.39 
 
 
649 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.139025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.74 
 
 
654 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1351  asparagine synthase  24.7 
 
 
640 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1346  asparagine synthase  25.78 
 
 
639 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1460  asparagine synthase  26.07 
 
 
634 aa  95.5  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0967  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.43 
 
 
676 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.9 
 
 
646 aa  91.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.57 
 
 
645 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.19 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.53 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4904  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.94 
 
 
613 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0220651  normal  0.122286 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1324  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  23.13 
 
 
622 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.44 
 
 
664 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.95 
 
 
593 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.55 
 
 
625 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.4 
 
 
660 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1153  asparagine synthase  26.7 
 
 
659 aa  74.3  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.5 
 
 
678 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2956  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.45 
 
 
678 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3533  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  21.65 
 
 
621 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.96 
 
 
624 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1965  asparagine synthase  26.25 
 
 
624 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595077  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.31 
 
 
666 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.21 
 
 
666 aa  71.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.86 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  29.39 
 
 
594 aa  70.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0185  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.19 
 
 
670 aa  70.5  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.43 
 
 
629 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.82 
 
 
602 aa  70.1  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0355  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.72 
 
 
636 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2657  asparagine synthase  21.47 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0825967  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.76 
 
 
638 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.62 
 
 
660 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5318  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.52 
 
 
657 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.79 
 
 
634 aa  67.8  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.11 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.15 
 
 
634 aa  67  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1026  asparagine synthase  25.84 
 
 
617 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0032  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.37 
 
 
672 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.579611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.66 
 
 
606 aa  66.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2952  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.93 
 
 
609 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.101456  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.82 
 
 
626 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3068  asparagine synthase  28.74 
 
 
611 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  23.05 
 
 
592 aa  64.3  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1216  asparagine synthase  25.42 
 
 
626 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108525  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.19 
 
 
625 aa  64.3  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.5 
 
 
629 aa  63.9  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.23 
 
 
629 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.68 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.85 
 
 
594 aa  63.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.58 
 
 
615 aa  62.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0777  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.81 
 
 
670 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.159884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  26.61 
 
 
590 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37560  asparagine synthetase, glutamine-hydrolysing  25.26 
 
 
610 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.761947  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.11 
 
 
610 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.55 
 
 
633 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0200  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.86 
 
 
655 aa  62  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2557  putative asparagine synthetase  25.11 
 
 
626 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.39 
 
 
595 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2826  asparagine synthase  29.19 
 
 
662 aa  61.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0050  asparagine synthase  25.45 
 
 
636 aa  61.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.46 
 
 
607 aa  60.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2829  asparagine synthase  26.81 
 
 
654 aa  60.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  22.84 
 
 
658 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3261  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.03 
 
 
671 aa  60.8  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  24.09 
 
 
633 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.83 
 
 
613 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  29.39 
 
 
595 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0125  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.46 
 
 
571 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  23.29 
 
 
605 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.94 
 
 
641 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.69 
 
 
632 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  29.39 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2789  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  24.94 
 
 
670 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.72 
 
 
601 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.45 
 
 
643 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  27.11 
 
 
595 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1505  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.74 
 
 
615 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.04 
 
 
662 aa  58.2  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  30.98 
 
 
590 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  21.88 
 
 
637 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  22.22 
 
 
637 aa  57.8  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.09 
 
 
633 aa  57.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.03 
 
 
650 aa  57.4  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3693  asparagine synthetase B  22.37 
 
 
615 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.810986  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  24.68 
 
 
593 aa  57.4  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  24.92 
 
 
589 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>