86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4724 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4724  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  830    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0242073  normal  0.178225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03614  hypothetical protein  35.35 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.707311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3056  hypothetical protein  36.31 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0885  hypothetical protein  37.91 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3359  hypothetical protein  35.4 
 
 		 368 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2343  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  32.99 
 
 		 191 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19210  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.82 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0193434  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.85 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4015  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.7 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.65 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.23 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.19 
 
 		 214 aa  50.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.592704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  26.49 
 
 		 300 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  30.41 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.63 
 
 		 255 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.16 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1999  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.01 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2448  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.35 
 
 		 469 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.07 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.94 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  32.17 
 
 		 679 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1369  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.41 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.15 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  29.55 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.55 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.78 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.16 
 
 		 285 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  32.8 
 
 		 250 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00144  Thiamine biosynthesis protein ThiF  33.04 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.16 
 
 		 292 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4133  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.97 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.6578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44749  sumo-activating enzyme 2  28.24 
 
 		 643 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.97194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 		 284 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.35 
 
 		 242 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.6 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.6 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.6 
 
 		 300 aa  46.6  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 		 281 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1950  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.01 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2450  adenylyltransferase ThiF  29.31 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.71 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1399  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.81 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.57 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  22.83 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  24.02 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  23.46 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  23.46 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  23.46 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  23.46 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  23.46 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  29.79 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  29.79 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  28.8 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.91 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.28 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.52 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.92 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  22.22 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1574  peptide chain release factor 2  29.36 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  38.71 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  27.13 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  25.28 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  21.89 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2199  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.67 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.28 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.52 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 		 264 aa  44.3  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3654  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.92 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.52 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  26.19 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  32 
 
 		 288 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.6 
 
 		 236 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0118  putative HesA/moeB/thiF family protein  27.27 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.53 
 
 		 243 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.48 
 
 		 267 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02000  NEDD8 activating enzyme, putative  24.2 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.08 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2652  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.03 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0490  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 		 220 aa  43.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 		 282 aa  43.1  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.03 
 
 		 285 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>