21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4466 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4466  replication initiation factor  100 
 
 		 380 aa  781    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979448  hitchhiker  0.000360835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1389  replication initiation factor  34.41 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0245511  normal  0.60169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2390  replication initiation factor  32.65 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0724  replication initiation factor  32.06 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2973  phage replication protein  36.82 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0488089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0887  putative phage replication initiation protein  32.02 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0553548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0367  putative phage replication initiation factor  32.02 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0594202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2103  replication initiation factor  32.2 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608188  normal  0.0902845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00564  phage replication protein  30.62 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1084  hypothetical protein  31 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848597  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1102  hypothetical protein  31 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000501354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0517  replication initiation factor  28.22 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.341925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0965  replication initiation factor  28.22 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000376009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0979  replication initiation factor  28.22 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0994  replication initiation factor  28.22 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.047597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2407  replication initiation factor  33.78 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0506  RstA1 protein  27.71 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.307749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1066  RstA1 protein  27.71 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1069  RstA1 protein  27.71 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.317105  n/a   
 
 
-
 
NC_008500  STER_A3  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0022  PhoH family protein  24.87 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.123804  normal  0.726212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>