68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1009 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1009  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0944  putative transmembrane protein  92.77 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337988  normal  0.0425003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  68.75 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  46.75 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  44.74 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  44.74 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  47.76 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  45.07 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  45.07 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  40.48 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  46.27 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  40.3 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  40.3 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  44.44 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  41.56 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  44.64 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  40.3 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  44.64 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  40.3 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  44.26 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  37.88 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  37.31 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  35.9 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  41.86 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  42.37 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  41.86 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  38.57 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  42.17 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  35.59 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  36.14 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>