More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0445 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  72.18 
 
 		 520 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 516 aa  1073    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  72.62 
 
 		 520 aa  758    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  78.35 
 
 		 532 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  78.56 
 
 		 532 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  78.56 
 
 		 532 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  96.32 
 
 		 516 aa  1033    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  78.56 
 
 		 532 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  72.13 
 
 		 524 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  78.35 
 
 		 532 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  75.31 
 
 		 530 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  60.25 
 
 		 527 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  78.56 
 
 		 532 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  72.35 
 
 		 530 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  78.56 
 
 		 532 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  63.41 
 
 		 486 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  73.35 
 
 		 520 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  72.35 
 
 		 530 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  78.14 
 
 		 532 aa  806    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  59.34 
 
 		 493 aa  623  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  60.9 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  60.45 
 
 		 500 aa  624  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  61.15 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  58.26 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  57.81 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  58.8 
 
 		 485 aa  609  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  58.52 
 
 		 503 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  60 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  58.73 
 
 		 494 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  56.73 
 
 		 497 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  55.49 
 
 		 499 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  54.66 
 
 		 499 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  52.67 
 
 		 491 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  55.92 
 
 		 498 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  55.46 
 
 		 494 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  52.04 
 
 		 491 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  53.65 
 
 		 495 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  53.55 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 489 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  51.55 
 
 		 494 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  53.66 
 
 		 510 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  54.02 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  52.87 
 
 		 508 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  53.8 
 
 		 509 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  54.89 
 
 		 479 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  51.75 
 
 		 489 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  51.13 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  51.13 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  51.33 
 
 		 508 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  51.09 
 
 		 507 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  51.91 
 
 		 494 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  49.59 
 
 		 508 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  53.1 
 
 		 504 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 		 477 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  50.72 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  48.97 
 
 		 491 aa  485  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  47.54 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  48.22 
 
 		 486 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  48.65 
 
 		 495 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  47.93 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  49.9 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  48.12 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  49.27 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  49.89 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  46.68 
 
 		 509 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  47.01 
 
 		 502 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  49.68 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  44.4 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  47.69 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  44.98 
 
 		 540 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.229134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  47.48 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  47.48 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  43.87 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  46.08 
 
 		 544 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  45.84 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  47.88 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  46.64 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  45.02 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  45.12 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  44.66 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  41.54 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  28.19 
 
 		 505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  28.15 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.6 
 
 		 816 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  27.48 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.38 
 
 		 816 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 642 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 642 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  30.24 
 
 		 661 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.69 
 
 		 818 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.28 
 
 		 816 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  29.28 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  29.85 
 
 		 565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  27.21 
 
 		 650 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13773  oxidoreductase  43.83 
 
 		 224 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  29.29 
 
 		 505 aa  147  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  28.51 
 
 		 816 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1881  cyclohexanone monooxygenase  28.54 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.296412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>