28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2450 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2450  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  818    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3244  hypothetical protein  70.05 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2219  hypothetical protein  70.48 
 
 		 389 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.576507  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0017  hypothetical protein  41.16 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0357647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0010  hypothetical protein  41.5 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.215513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5294  hypothetical protein  38.5 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  0.193675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2316  hypothetical protein  41.23 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00383771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4439  hypothetical protein  55.81 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0430  hypothetical protein  60.22 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0347  hypothetical protein  59.88 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3254  hypothetical protein  49.6 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0583946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2080  hypothetical protein  61.9 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1649  hypothetical protein  55.14 
 
 		 447 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.633116  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1142  hypothetical protein  52.46 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1203  hypothetical protein  45.64 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3572  hypothetical protein  69.67 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1363  hypothetical protein  45.23 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0421  hypothetical protein  47.28 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.775232  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1193  hypothetical protein  47.03 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1353  hypothetical protein  46.85 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.986887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1735  hypothetical protein  56.1 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1132  hypothetical protein  65.85 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1541  hypothetical protein  56.25 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1003  hypothetical protein  69.11 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0945  hypothetical protein  69.11 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1297  hypothetical protein  65.04 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4302  hypothetical protein  62.6 
 
 		 347 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  hitchhiker  0.0071391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0791  hypothetical protein  59.17 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>