49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1575 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1575  Sulphur oxidation protein SoxZ  100 
 
 		 111 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3673  sulfur compound chelating protein SoxZ  44.86 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2805  putative sulphur oxidation protein  41.3 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.369678 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3916  hypothetical protein  40.86 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4152  sulfur oxidation Z protein  36.54 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4254  putative sulfur oxidation protein SoxZ  39.18 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.196263  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4959  Sulphur oxidation protein SoxZ  37.25 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4158  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.54 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7670  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.89 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4370  putative sulfur oxidation protein SoxZ  38.14 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1520  sulphur oxidation protein SoxZ  37.27 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1269  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6958  sulphur oxidation protein SoxZ  34.62 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2762  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.62 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1155  putative sulfur oxidation protein  33.33 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.77518  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0064  sulphur oxidation protein SoxZ  36.96 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.956687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1907  hypothetical protein  32.08 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0857144  normal  0.079007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3715  hypothetical protein  32.08 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.104984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3092  sulfur compound chelating protein SoxZ  42.19 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2283  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.04 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1592  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.14 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1668  Sulphur oxidation protein SoxZ  36.14 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0036  sulphur oxidation protein SoxZ  34.94 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2222  Sulphur oxidation protein SoxZ  34.94 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1474  putative secreted protein  35.48 
 
 		 258 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0565  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.41 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2998  sulfur compound chelating protein SoxZ  27.27 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2435  sulfur compound chelating protein SoxZ  33.33 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0804  sulfur oxidation protein (SoxZ)  31.33 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1035  Sulphur oxidation protein SoxZ  30.12 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.876216  normal  0.48682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0262  sulfur compound chelating protein SoxZ  31.03 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000855271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3422  sulfur compound chelating protein SoxZ  34.29 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0695  hypothetical protein  29.63 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0144  sulphur oxidation protein SoxZ  28.26 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2628  sulfur compound chelating protein SoxZ  29.21 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0813  Sulphur oxidation protein SoxZ  33.8 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000524393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3254  sulfur compound chelating protein SoxZ  32.86 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75878  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0515  Sulphur oxidation protein SoxZ  20.88 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000277192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3781  sulphur oxidation protein SoxZ  34.38 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3674  sulfur oxidation protein  26.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3131  sulfur compound chelating protein SoxZ  37.29 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1924  sulfur oxidation protein SoxZ  30.86 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1989  sulfur compound-chelating protein SoxZ  30.49 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2858  Sulfur oxidation protein SoxZ  24.21 
 
 		 108 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3258  hypothetical protein  29.55 
 
 		 103 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1259  Sulphur oxidation protein SoxZ  32.18 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3456  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.24 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3128  Sulphur oxidation protein SoxZ  28.24 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0602  hypothetical protein  31.67 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0709079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>