More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0811 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0811  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 369 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0616  acyl-CoA dehydrogenase-like  71.63 
 
 		 358 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0720  Acyl-CoA dehydrogenase-like  70.94 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.24 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.15 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.7 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.76 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  34.76 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.29 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001543  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.1 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.31 
 
 		 389 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  31.75 
 
 		 580 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.9 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.07 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.95 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.31 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000377  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.72 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.749145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.97 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.96 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.93 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.66 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  28.64 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.28 
 
 		 580 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.34 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.66 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.96 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.28 
 
 		 580 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.66 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.49 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  28.14 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  33.63 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.52 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.43 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  33.66 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.66 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.48 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.37 
 
 		 390 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.69 
 
 		 579 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.6 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  34.5 
 
 		 410 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  35.48 
 
 		 407 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  27.78 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.37 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.18 
 
 		 384 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3835  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.49 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.588687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2182  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.57 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000233071  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3948  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.49 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0664421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  33.67 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3882  butyryl-CoA dehydrogenase  35.71 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5206  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  33.65 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4184  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.948009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.36 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.18 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.16 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.34 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2399  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.470639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.34 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.94 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.34 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.06 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.46 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  32.8 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  32.8 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4927  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.06 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0697  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.37 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.21 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.29 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.45 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  27.94 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.57 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0428  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.82 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.871589  normal  0.2576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5007  acyl-CoA dehydrogenase  34.78 
 
 		 378 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1327  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.57 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.61 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  29.84 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2830  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.16 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  33.5 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  30.69 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  30.69 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  29.84 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5908  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.5 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.63 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  30.37 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.38 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  32.12 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  30.37 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  30.37 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.07 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.16 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  30.37 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0292  acyl-CoA dehydrogenase  29.51 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.66 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.57 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.74 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>