212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1980 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
188 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  87.63 
 
 
191 aa  330  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.6 
 
 
179 aa  241  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.46 
 
 
185 aa  200  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.46 
 
 
185 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.46 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.22 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.56 
 
 
187 aa  197  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55 
 
 
187 aa  187  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.59 
 
 
178 aa  184  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.35 
 
 
192 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.83 
 
 
190 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.25 
 
 
191 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  55.14 
 
 
195 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.91 
 
 
192 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.14 
 
 
195 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.35 
 
 
192 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.91 
 
 
190 aa  174  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.7 
 
 
190 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.14 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  55.8 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.7 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  56.91 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.8 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  55.25 
 
 
190 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
190 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.01 
 
 
187 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.14 
 
 
192 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.14 
 
 
192 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
191 aa  170  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.7 
 
 
191 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2349  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.75 
 
 
177 aa  169  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.952364  normal  0.0113032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.52 
 
 
189 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  44.21 
 
 
190 aa  168  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.43 
 
 
192 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  54.95 
 
 
192 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
187 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1904  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.63 
 
 
177 aa  167  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.16 
 
 
194 aa  167  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.7 
 
 
190 aa  167  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  54.44 
 
 
190 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.25 
 
 
190 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.64 
 
 
190 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.95 
 
 
192 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.68 
 
 
196 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.04 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.9 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.78 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.76 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.5 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.26 
 
 
186 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.82 
 
 
185 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.46 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.46 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2316  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.89 
 
 
177 aa  160  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.17 
 
 
182 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.3 
 
 
192 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.55 
 
 
192 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0392  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.13 
 
 
177 aa  157  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.56 
 
 
186 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.8 
 
 
196 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.85 
 
 
189 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  45.81 
 
 
184 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.15 
 
 
184 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.62 
 
 
191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.13 
 
 
203 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.66 
 
 
196 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
192 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.25 
 
 
190 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.23 
 
 
196 aa  153  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.91 
 
 
190 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.22 
 
 
185 aa  153  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.75 
 
 
190 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.3 
 
 
190 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3022  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.29 
 
 
179 aa  152  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2492  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.04 
 
 
187 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
196 aa  151  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.1 
 
 
195 aa  151  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.89 
 
 
184 aa  150  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.3 
 
 
183 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.55 
 
 
190 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.8 
 
 
189 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.41 
 
 
242 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.78 
 
 
193 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.78 
 
 
193 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.24 
 
 
190 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.24 
 
 
190 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.04 
 
 
183 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.24 
 
 
191 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.24 
 
 
191 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.24 
 
 
190 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.24 
 
 
191 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.82 
 
 
185 aa  148  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  47.78 
 
 
193 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.7 
 
 
187 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  47.78 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  44.89 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.75 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.75 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>