43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1859 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  70.03 
 
 		 622 aa  868    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1205    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  72.79 
 
 		 597 aa  878    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  35.62 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.22 
 
 		 279 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  24.27 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  35.43 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  32.36 
 
 		 558 aa  83.6  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  27.73 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  29.91 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  32.37 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.69 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.04 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  33.17 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.73 
 
 		 260 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  29.2 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  24.68 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  29.8 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  31.43 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.78 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.83 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  25 
 
 		 429 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  30.32 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.88 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  24.79 
 
 		 266 aa  57  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  26.81 
 
 		 315 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.5 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.15 
 
 		 289 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  24.81 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  25.7 
 
 		 282 aa  55.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  23.35 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  32.65 
 
 		 242 aa  51.6  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  28.16 
 
 		 240 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  21.25 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.41 
 
 		 285 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.63 
 
 		 237 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  20.99 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  30.24 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.49 
 
 		 247 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.49 
 
 		 247 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  27.75 
 
 		 254 aa  44.3  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>