38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5957 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5957    100 
 
 		 1182 bp  2343    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0111305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  82.72 
 
 		 1530 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  82.72 
 
 		 1530 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  82.72 
 
 		 1530 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  82.72 
 
 		 1530 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  82.72 
 
 		 1530 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  82.72 
 
 		 1530 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1167    82.72 
 
 		 3476 bp  468  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366883  normal  0.484716 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6373    100 
 
 		 228 bp  222  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  79.87 
 
 		 825 bp  119  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  82.76 
 
 		 1101 bp  107  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  81.15 
 
 		 1554 bp  93.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3042    90.14 
 
 		 489 bp  85.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0204685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0632    89.23 
 
 		 469 bp  73.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  89.83 
 
 		 1536 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  89.83 
 
 		 1536 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  89.83 
 
 		 1536 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  89.83 
 
 		 1536 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  89.83 
 
 		 1536 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  89.83 
 
 		 1536 bp  69.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  88.14 
 
 		 1536 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  88.14 
 
 		 1536 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  83.52 
 
 		 1554 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  83.52 
 
 		 1560 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  83.52 
 
 		 1308 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  83.52 
 
 		 1560 bp  61.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  91.49 
 
 		 1536 bp  61.9  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0710  transposase IS66  88.89 
 
 		 729 bp  60  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1594    80.43 
 
 		 1329 bp  60  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  94.74 
 
 		 1515 bp  60  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  94.74 
 
 		 1515 bp  60  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  94.74 
 
 		 1515 bp  60  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0744    84.51 
 
 		 702 bp  54  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0745    84.51 
 
 		 540 bp  54  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3355    92.31 
 
 		 467 bp  54  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  91.89 
 
 		 1524 bp  50.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  91.89 
 
 		 1524 bp  50.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  83.12 
 
 		 1572 bp  50.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>