75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0585 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0585  amidinotransferase  100 
 
 		 292 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2672  amidinotransferase  82.69 
 
 		 296 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3467  amidinotransferase  53.57 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.501017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3360  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  40.5 
 
 		 705 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0297131  normal  0.880976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2742  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  40.5 
 
 		 705 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3854  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  40.5 
 
 		 704 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4659  hypothetical protein  38.71 
 
 		 703 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0175942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3232  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain protein  38.35 
 
 		 705 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2273  hypothetical protein  39.07 
 
 		 703 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4047  LOR/SDH bifunctional protein conserved domain-containing protein  37.63 
 
 		 703 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1814  amidinotransferase family protein  31.91 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0382  amidinotransferase family protein  31.56 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0222666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2147  amidinotransferase  38.24 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 680 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3814  amidinotransferase  38.35 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5070  amidinotransferase  36.76 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0780  amidinotransferase  37.18 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1169  amidinotransferase  36.26 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.730709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1021  amidinotransferase  35.29 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4052  amidinotransferase  36.63 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402053  normal  0.043057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0993  amidinotransferase  35.29 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1011  amidinotransferase  35.29 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3676  amidinotransferase  36.23 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0887  amidinotransferase  36.76 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.766224  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2664  amidinotransferase  36.93 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1802  amidinotransferase  34.89 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1288  amidinotransferase  34.56 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254269  normal  0.122965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2012  amidinotransferase  36.03 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6044  amidinotransferase  35.14 
 
 		 271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7970  amidinotransferase  34.93 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12346  hypothetical protein  33.58 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2244  amidinotransferase  35.9 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6661  amidinotransferase  35.29 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0754101  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0453  amidinotransferase  33.09 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2331  amidinotransferase  32.85 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3304  amidinotransferase  33.81 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1316  amidinotransferase  35.23 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0130  amidinotransferase  33.7 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30700  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  33.93 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4529  amidinotransferase  32.38 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03350  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  32.5 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5039  amidinotransferase  33.33 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1775  amidinotransferase  21.28 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00023093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3188  amidinotransferase  23.26 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  25.77 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0127  Dimethylargininase  27.24 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1816  Dimethylargininase  26.02 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000313544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2706  amidinotransferase  22.65 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  24.73 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4094  amidinotransferase  27.8 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48840  hypothetical protein  26.12 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.397949  decreased coverage  0.000000000411492 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1622  hypothetical protein  23.83 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1628  hypothetical protein  22.98 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05885  DdaH family protein  23.68 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.542101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4183  hypothetical protein  27.2 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0020  amidinotransferase  27.17 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0428  amidinotransferase  24.28 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  23.39 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4639  amidinotransferase  25.2 
 
 		 252 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5166  amidinotransferase  26.36 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2905  Dimethylargininase  23.08 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0765  amidinotransferase  25.87 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  24 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3320  dimethylargininase  25.91 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3837  dimethylargininase  25.51 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456176  normal  0.996067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2100  Dimethylargininase  26.16 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2396  dimethylargininase  23.67 
 
 		 253 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3241  Dimethylargininase  26.2 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4521  amidinotransferase  24.91 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2143  dimethylargininase  23.67 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434845  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3194  amidinotransferase  22.98 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  23.48 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2108  amidinotransferase  25.11 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  23.53 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13990  N-dimethylarginine dimethylaminohydrolase  23.27 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>