40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2626 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2626  Outer membrane protein/protective antigen OMA87- like protein  100 
 
 
416 aa  827    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000575123  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.97 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  29.52 
 
 
643 aa  56.6  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  27.69 
 
 
792 aa  54.3  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  36.36 
 
 
553 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.41 
 
 
767 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  32.5 
 
 
555 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  29.81 
 
 
683 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  31.87 
 
 
598 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  30.43 
 
 
547 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  28.3 
 
 
784 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
768 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
768 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
768 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
769 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
768 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
769 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  27.81 
 
 
769 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  27.27 
 
 
768 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  33.77 
 
 
769 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.57 
 
 
769 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.57 
 
 
769 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.57 
 
 
769 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.81 
 
 
769 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.02 
 
 
769 aa  46.6  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.27 
 
 
768 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.53 
 
 
768 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.68 
 
 
752 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  30.08 
 
 
765 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  28.91 
 
 
781 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1473  surface antigen (D15)  30.59 
 
 
856 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000179625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.77 
 
 
769 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.65 
 
 
770 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  33.65 
 
 
925 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.3 
 
 
1349 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  29.32 
 
 
779 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.59 
 
 
585 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.59 
 
 
765 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  27.59 
 
 
765 aa  43.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  32.28 
 
 
665 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>