49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1867 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1867  WbqC-like family protein  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0238  WbqC-like family protein  28.19 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5672  WbqC-like family protein  25.22 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.397575  normal  0.0211731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2851  hypothetical protein  23.98 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0505  WbqC-like family protein  25.76 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000101608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5397  WbqC-like family protein  26.72 
 
 		 243 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1293  hypothetical protein  27.75 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1218  WbqC-like family protein  27.68 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0831  WbqC-like family protein  26.03 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.064129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0361  hypothetical protein  31.09 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0167  hypothetical protein  27.73 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1134  WbqC-like family protein  23.56 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0285  hypothetical protein  27.98 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1369  WbqC-like family protein  24.88 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1809  WbqC-like family protein  25.7 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0158  WbqC-like family protein  28.12 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4402  hypothetical protein  24.68 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3729  WbqC-like family protein  26.99 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0415  WbqC-like family protein  26.57 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393532  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0207  hypothetical protein  21.96 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3120  hypothetical protein  22.79 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236113  hitchhiker  0.00120592 
 
 
-
 
NC_002950  PG1999  hypothetical protein  23.7 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.390702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0640  WbqC-like family protein  27.8 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.636618  normal  0.417336 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0302  WbqC-like family protein  23.15 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000985813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11538  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.354473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07090  hypothetical protein  25.84 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5018  WbqC-like family protein  22.27 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2171  WbqC-like family protein  24.86 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.547253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6224  WbqC-like family protein  23.9 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3056  hypothetical protein  23.15 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3312  WbqC-like family protein  24.14 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360006  normal  0.612167 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4741  WbqC-like family protein  23.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3664  WbqC-like family protein  23.85 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.592611  normal  0.677905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2775  WbqC-like family protein  21.03 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3754  WbqC-like family protein  25.11 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0464  hypothetical protein  23.27 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0458  hypothetical protein  23.27 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5237  hypothetical protein  24.19 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345419  normal  0.57885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1307  hypothetical protein  24.02 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2744  hypothetical protein  26.94 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2174  Seryl-tRNA synthetase, class IIa-like protein  34.09 
 
 		 352 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0768  hypothetical protein  26.64 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3907  hypothetical protein  26.16 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1578  hypothetical protein  25.73 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2997  hypothetical protein  23.98 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0342521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1077  hypothetical protein  19.8 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.196873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2574  WbqC-like family protein  20.35 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.671776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>