23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0428 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1772  hypothetical protein  43.8 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2504  hypothetical protein  37.1 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2206  hypothetical protein  38.33 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000336434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2486  hypothetical protein  35.9 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1815  hypothetical protein  33.05 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.245824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4898  hypothetical protein  36.45 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4280  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1237  hypothetical protein  39.29 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.106406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4084  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2494  hypothetical protein  30.58 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.255706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0440  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1637  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0635046  hitchhiker  0.001286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5909  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1888  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1771  hypothetical protein  28.33 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.300159  normal  0.312594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2777  hypothetical protein  26.05 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3291  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4168  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000529234  decreased coverage  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0279  hypothetical protein  29.31 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.457399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  27.83 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  31.48 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>