18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6079 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6079  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  80.22 
 
 
252 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  71.11 
 
 
253 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  66.3 
 
 
251 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  53.26 
 
 
253 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  53.26 
 
 
253 aa  95.9  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  63.04 
 
 
250 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5203  hypothetical protein  51 
 
 
257 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  59.34 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  47.83 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3767  hypothetical protein  64.29 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  48.28 
 
 
249 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4574  hypothetical protein  44.21 
 
 
253 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5034  hypothetical protein  44.21 
 
 
253 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0204633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5092  hypothetical protein  53.03 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.821944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  47.67 
 
 
249 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4463  hypothetical protein  35.23 
 
 
259 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.207507  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  36.67 
 
 
265 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>