29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5296 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5296  putative transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3957  RpiR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  31.48 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3563  RpiR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 284 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1136  transcriptional regulator, RpiR family  37.04 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0983  transcriptional regulator, RpiR family  37.04 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4854  putative transcriptional regulator, RpiR family  36.71 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.184524  normal  0.0902185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2067  RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3546  RpiR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 334 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 294 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 286 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 294 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 294 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 311 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 319 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 285 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0986  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 299 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  26.19 
 
 		 302 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  42.62 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 310 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  33.78 
 
 		 293 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 326 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  38.33 
 
 		 320 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 292 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>