41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1569 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  100 
 
 		 456 aa  945    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  38.66 
 
 		 427 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  37.09 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  37.85 
 
 		 300 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  34.04 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  38.03 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  31.78 
 
 		 342 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  40.43 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  42.72 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  28.21 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  29.81 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  32.87 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  44.05 
 
 		 119 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  38.24 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  34.19 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  53.06 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  34.59 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  27.01 
 
 		 229 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  27.92 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  39.08 
 
 		 224 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0610  FRG domain protein  29.29 
 
 		 261 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05340  FRG domain protein  26.89 
 
 		 311 aa  50.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6563  hypothetical protein  24.36 
 
 		 246 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  36.78 
 
 		 209 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  33.93 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  33.93 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  24.73 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  35.87 
 
 		 261 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  36.67 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6277  FRG domain-containing protein  24.73 
 
 		 246 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667411 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  23.74 
 
 		 247 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  32.97 
 
 		 262 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6907  FRG domain-containing protein  31.48 
 
 		 298 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  33.72 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  34.57 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  31.91 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0169  FRG domain protein  31.63 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  63.33 
 
 		 243 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4453  FRG domain-containing protein  34.44 
 
 		 233 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>