62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3076 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3076  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 155 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3333  hypothetical protein  87.04 
 
 		 162 aa  258  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  30.34 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  32.86 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  30.16 
 
 		 489 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  33.72 
 
 		 417 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  28.83 
 
 		 380 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  29.6 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  28.68 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0132  paraquat-inducible protein A  29.2 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246044  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  29.91 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  32.22 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  33.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  28.57 
 
 		 402 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  26.92 
 
 		 426 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  31.11 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  32.79 
 
 		 417 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  28.97 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  28.81 
 
 		 423 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  27.2 
 
 		 224 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  28.97 
 
 		 219 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  25.89 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  36.71 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  36.71 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  36.71 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  36.71 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  29.23 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  31.18 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  31.63 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  26.79 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  36.71 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  31.11 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  29.03 
 
 		 449 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  26.79 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  26.79 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  27.94 
 
 		 444 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  29.23 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  26.77 
 
 		 207 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  28.23 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  27.34 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  43.42 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  32.63 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  28 
 
 		 220 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  27.42 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  27.42 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  26.13 
 
 		 434 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  26.37 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  29.35 
 
 		 324 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>