29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0829 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.96 
 
 		 154 aa  277  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  35.25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  35.53 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.87 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  35.53 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.21 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  33.33 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  28.7 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  32.84 
 
 		 376 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  34.21 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 370 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  28.57 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  45.83 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  27.88 
 
 		 171 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2770  auxin-binding protein-like protein  31.63 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  34.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  33.78 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>