29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0348 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0348  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0380  hypothetical protein  94.65 
 
 
187 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.651706  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  62.5 
 
 
183 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0776  hypothetical protein  47.59 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1157  hypothetical protein  39.22 
 
 
193 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6518  hypothetical protein  39.72 
 
 
153 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1121  hypothetical protein  41.14 
 
 
160 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0269  hypothetical protein  31.87 
 
 
178 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1697  hypothetical protein  41.26 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.091579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4183  hypothetical protein  40.67 
 
 
205 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1034  hypothetical protein  39.74 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  41.67 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  41.84 
 
 
156 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1129  hypothetical protein  39.74 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  42.36 
 
 
160 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3587  hypothetical protein  35.46 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0052  hypothetical protein  32.87 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  28.7 
 
 
119 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  28.7 
 
 
119 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.11 
 
 
291 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  30.43 
 
 
113 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.47 
 
 
291 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  30.34 
 
 
109 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  29.58 
 
 
115 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  29 
 
 
109 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  28.75 
 
 
108 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  30.26 
 
 
114 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  27.27 
 
 
111 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>