161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3409 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3409  peptidase T2, asparaginase 2  100 
 
 		 275 aa  554  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0141  asparaginase  79.62 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3101  peptidase T2, asparaginase 2  78.46 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3001  Beta-aspartyl-peptidase  68.58 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4589  peptidase T2, asparaginase 2  69.35 
 
 		 320 aa  344  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258837  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3245  peptidase T2 asparaginase 2  68.94 
 
 		 325 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4227  asparaginase  60 
 
 		 340 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1317  peptidase T2 asparaginase 2  61.3 
 
 		 320 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0193765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3976  peptidase T2 asparaginase 2  62.07 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1251  peptidase T2 asparaginase 2  60.15 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205112  normal  0.873141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4114  peptidase T2 asparaginase 2  59.77 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4403  peptidase T2 asparaginase 2  59 
 
 		 315 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1869  peptidase T2, asparaginase 2  60 
 
 		 335 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119371  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0834  peptidase T2, asparaginase 2  62.64 
 
 		 330 aa  298  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1656  asparaginase  63.6 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1378  L-asparaginase precursor protein  59.32 
 
 		 320 aa  298  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3132  Asparaginase  60.75 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1549  peptidase T2 asparaginase 2  57.85 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1322  L-asparaginase  59.54 
 
 		 312 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0141  peptidase T2 asparaginase 2  59 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.122192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2816  L-asparaginase  58.78 
 
 		 321 aa  292  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0886  L-asparaginase  58.78 
 
 		 321 aa  292  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0948  L-asparaginase  59.54 
 
 		 313 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2814  peptidase T2 asparaginase 2  58.78 
 
 		 321 aa  291  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137606  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0998  L-asparaginase  59.54 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0888  L-asparaginase  59.54 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.898156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0853  L-asparaginase  58.78 
 
 		 321 aa  291  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00795  L-asparaginase  58.78 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00812  hypothetical protein  58.78 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0899  L-asparaginase  58.78 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0977  L-asparaginase  59.16 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0915  L-asparaginase  59.16 
 
 		 313 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1928  asparaginase  60.92 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270438  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4428  asparaginase  61.54 
 
 		 329 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1771  asparaginase  57.4 
 
 		 344 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.483538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2520  L-asparaginase  58.02 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1111  asparaginase family protein  57.09 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.756996  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0405  asparaginase family protein  56.58 
 
 		 348 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0236  asparaginase family protein  56.58 
 
 		 348 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1362  asparaginase family protein  56.58 
 
 		 348 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0443922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3898  peptidase T2, asparaginase 2  57.78 
 
 		 339 aa  283  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1856  asparaginase  56.23 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1576  peptidase T2 asparaginase 2  58 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0973  asparaginase family protein  55.02 
 
 		 356 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0326  asparaginase  56.23 
 
 		 687 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3569  peptidase T2, asparaginase 2  59.02 
 
 		 335 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304654  normal  0.126067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4050  peptidase T2 asparaginase 2  58.65 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1111  asparaginase family protein  55.12 
 
 		 343 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3355  peptidase T2 asparaginase 2  59.85 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.209488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0246  peptidase T2 asparaginase 2  52.16 
 
 		 363 aa  275  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4205  peptidase T2, asparaginase 2  56.88 
 
 		 345 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4161  peptidase T2, asparaginase 2  56.88 
 
 		 345 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00224968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1406  asparaginase  60.15 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0225592  normal  0.0880734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03725  asparaginase  49.81 
 
 		 356 aa  267  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0741  peptidase T2 asparaginase 2  54.41 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4722  asparaginase  50.55 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1617  asparaginase family protein  52.81 
 
 		 327 aa  254  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.202156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2171  peptidase T2, asparaginase 2  49.81 
 
 		 348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2686  peptidase T2 asparaginase 2  51.67 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4155  Beta-aspartyl-peptidase  52.31 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3603  peptidase T2 asparaginase 2  52.27 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.0219644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3233  peptidase T2 asparaginase 2  53.44 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163663  normal  0.687988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1904  peptidase T2 asparaginase 2  51.3 
 
 		 343 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2115  asparaginase family protein  51.3 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1837  peptidase T2, asparaginase 2  49.64 
 
 		 343 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2140  peptidase T2, asparaginase 2  49.64 
 
 		 343 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0198242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2389  peptidase T2 asparaginase 2  51.3 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.858086  normal  0.179697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2508  peptidase T2, asparaginase 2  48.04 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.178704  normal  0.567192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1898  peptidase T2, asparaginase 2  49.82 
 
 		 343 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.519562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1937  peptidase T2 asparaginase 2  50.56 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1930  peptidase T2 asparaginase 2  50.56 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1895  peptidase T2, asparaginase 2  49.29 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2435  asparaginase  47.04 
 
 		 361 aa  245  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1612  Asparaginase  55.02 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1445  peptidase T2, asparaginase 2  50.19 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1393  L-asparaginase  46.33 
 
 		 344 aa  240  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.414746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3084  peptidase T2 asparaginase 2  50.76 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1012  peptidase T2 asparaginase 2  51.21 
 
 		 426 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1122  peptidase T2 asparaginase 2  51.33 
 
 		 338 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4764  hitchhiker  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4294  peptidase T2 asparaginase 2  53.44 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.000452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2166  peptidase T2, asparaginase 2  51.54 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2824  peptidase T2, asparaginase 2  50 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0560418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02403  Asparaginase family protein  51.21 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2181  putative asparaginase  50.2 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1162  peptidase T2, asparaginase 2  48.5 
 
 		 354 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970303  normal  0.0702479 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1791  putative L-asparaginase  44.79 
 
 		 343 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0630  peptidase T2 asparaginase 2  48.85 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0429768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00065  L-asparaginase  50.2 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1716  peptidase T2, asparaginase 2  52.21 
 
 		 315 aa  214  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002289  asp-X dipeptidase  47.62 
 
 		 317 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0809544  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7322  asparaginase  48.02 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0516  peptidase T2 asparaginase 2  47.13 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01470  asparaginase  45.98 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.666987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2127  peptidase T2, asparaginase 2  48.85 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13940  asparaginase  47.83 
 
 		 321 aa  198  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.885662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1369  peptidase T2 asparaginase 2  44.91 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.910347  normal  0.265326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0025  asparaginase  47.41 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1593  Asparaginase  48.78 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4831  peptidase T2 asparaginase 2  46.12 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1498  Asparaginase  48.37 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>