23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3167 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  100 
 
 		 349 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3575  sporulation domain-containing protein  44.24 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409926  normal  0.380426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  41.57 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  41.33 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  45.95 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 		 313 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1762  hypothetical protein  23.38 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0223856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  33.55 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  40 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  40.54 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  40.54 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2012  hypothetical protein  23.42 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  43.28 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  41.43 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  41.79 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  35.06 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  34.15 
 
 		 228 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  40.51 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  38.37 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  25.76 
 
 		 215 aa  42.7  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1730  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0770379  normal  0.0986357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>