19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0630 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0630  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  750    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.313978  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4104  S-layer domain protein  43.48 
 
 
416 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4065  S-layer domain protein  43.48 
 
 
416 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1974  Sporulation domain protein  39.56 
 
 
362 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.160258  normal  0.0302087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1947  Sporulation domain protein  39.56 
 
 
362 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0039  hypothetical protein  41.44 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  40.35 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4842  hypothetical protein  36.32 
 
 
287 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1338  hypothetical protein  37.89 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.193609  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2467  hypothetical protein  37.21 
 
 
242 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2943  hypothetical protein  40.37 
 
 
191 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27821  hypothetical protein  38.36 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2152  hypothetical protein  36.4 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2272  hypothetical protein  36.02 
 
 
209 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03111  hypothetical protein  37.36 
 
 
247 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0411  hypothetical protein  37.71 
 
 
196 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2520  hypothetical protein  32.98 
 
 
585 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0724  hypothetical protein  32 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  30.4 
 
 
1218 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>