138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1763 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1763  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1542  hypothetical protein  78.11 
 
 		 192 aa  277  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2375  hypothetical protein  73.99 
 
 		 205 aa  273  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2962  protein of unknown function DUF1234  72.73 
 
 		 191 aa  268  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4591  hypothetical protein  72.62 
 
 		 216 aa  254  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2544  hypothetical protein  71.43 
 
 		 193 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.424975  normal  0.0227832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5218  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5167  hypothetical protein  43.98 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5074  hypothetical protein  43.98 
 
 		 193 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.801454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0326  hypothetical protein  43.75 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0131678  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5224  hypothetical protein  43.98 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0298  hypothetical protein  43.98 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4343  hypothetical protein  44.32 
 
 		 193 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3997  protein of unknown function DUF1234  43.93 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0372283  normal  0.379292 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1653  hypothetical protein  44.57 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02530  hypothetical protein  44.44 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000815463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0284  hypothetical protein  44.44 
 
 		 193 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2133  protein of unknown function DUF1234  44 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0928493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2133  hypothetical protein  43.6 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.15092e-19  decreased coverage  0.0000713807 
 
 
-
 
NC_004310  BR1327  hypothetical protein  46.07 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00305825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0050  hypothetical protein  44.83 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0858  alpha/beta fold family hydrolase  39.77 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1067  hypothetical protein  41.85 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1924  protein of unknown function DUF1234  42.77 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1857  hypothetical protein  44.2 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0115527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1495  hypothetical protein  44.19 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.114257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0845  hypothetical protein  37.02 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0221  hypothetical protein  43.18 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0077  hypothetical protein  40.8 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0049  protein of unknown function DUF1234  42.61 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.47324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0049  protein of unknown function DUF1234  41.14 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0030  hypothetical protein  42.61 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102524 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0836  hypothetical protein  37.02 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1283  hypothetical protein  44.24 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2518  hypothetical protein  40.12 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2134  hypothetical protein  44.83 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.288994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1722  protein of unknown function DUF1234  44.25 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2842  hypothetical protein  40.36 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31700  hypothetical protein  42.7 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2379  hypothetical protein  36 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3781  hypothetical protein  41.04 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000225308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1283  protein of unknown function DUF1234  39.56 
 
 		 224 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0206203  normal  0.287726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2197  hypothetical protein  36.72 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3178  protein of unknown function DUF1234  36.78 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1908  hypothetical protein  39.43 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1786  hypothetical protein  45.4 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.188793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1220  protein of unknown function DUF1234  39.01 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389413  normal  0.138003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2122  protein of unknown function DUF1234  45.4 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.890414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1344  hypothetical protein  40.32 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2503  hypothetical protein  38.51 
 
 		 213 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.265063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2317  hypothetical protein  41.86 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2680  hypothetical protein  43.71 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.606454  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2551  hypothetical protein  44.89 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1429  protein of unknown function DUF1234  38.55 
 
 		 195 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0052  hypothetical protein  38.38 
 
 		 211 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1375  hypothetical protein  40.8 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0834  protein of unknown function DUF1234  36.05 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.839613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0067  hypothetical protein  38.42 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39608  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2952  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0055  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0197  hypothetical protein  40.91 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6307  hypothetical protein  38.24 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7556  protein of unknown function DUF1234  38.07 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1485  protein of unknown function DUF1234  36.69 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2133  hypothetical protein  41.11 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1838  hypothetical protein  42.13 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.951981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1908  hypothetical protein  41.14 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1311  protein of unknown function DUF1234  36.14 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3004  hypothetical protein  37.65 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2343  hypothetical protein  37.65 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2957  hypothetical protein  37.65 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5117  hypothetical protein  42.08 
 
 		 204 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1097  protein of unknown function DUF1234  39.52 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6816  hypothetical protein  39.2 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5573  protein of unknown function DUF1234  38.29 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0201605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2404  hypothetical protein  39.66 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4810  protein of unknown function DUF1234  40.59 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.077469  normal  0.951292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3733  protein of unknown function DUF1234  40.59 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2867  hypothetical protein  38.6 
 
 		 207 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.831648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2978  hypothetical protein  37.06 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0442  protein of unknown function DUF1234  36.47 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2826  protein of unknown function DUF1234  42.05 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0211367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1615  hypothetical protein  40.34 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.797887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0167  hypothetical protein  37.87 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0316  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1284  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4551  hypothetical protein  38.86 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1385  hypothetical protein  40.57 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.376399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1971  hypothetical protein  37.97 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1318  hypothetical protein  39.43 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.136684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1309  hypothetical protein  39.55 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1604  hypothetical protein  37.91 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6059  protein of unknown function DUF1234  37.29 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0546  esterase of the alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0356  putative hydrolase  38.37 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0370  putative hydrolase  38.37 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5293  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0120  alpha/beta hydrolase fold esterase-like protein  35.94 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199558  hitchhiker  0.000191951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4421  hypothetical protein  37.97 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0925  hypothetical protein  38.86 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>