22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1223 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1223  ABC-type transport system periplasmic component  100 
 
 		 299 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2658  ABC-type transport system periplasmic component  58.92 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1790  hypothetical protein  57.24 
 
 		 343 aa  345  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0502683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  59.32 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  59.32 
 
 		 336 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1818  hypothetical protein  57.58 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0011  hypothetical protein  56.12 
 
 		 324 aa  324  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000604844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0553  hypothetical protein  52.3 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2918  hypothetical protein  54.58 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184503  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0978  ABC-type transport system periplasmic component  37.41 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  26.94 
 
 		 433 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  24.12 
 
 		 390 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  24.71 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  25.9 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  21.91 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  26.37 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.95 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  31.71 
 
 		 579 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  23.53 
 
 		 390 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  21.45 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  22.1 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  22.61 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>