47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0697 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0697  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2431  esterase/lipase/thioesterase family protein  50.17 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1571  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2522  hydrolase, exosortase system type 1 associated  43.42 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  45.28 
 
 		 597 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1962  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.76 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0274  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.91 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3123  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.71 
 
 		 256 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  30.29 
 
 		 638 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  31.25 
 
 		 638 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  29.21 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  31.22 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  31.61 
 
 		 588 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  27.35 
 
 		 893 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  29.03 
 
 		 413 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  31.13 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  36.25 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1933  hypothetical protein  27.57 
 
 		 230 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  34.57 
 
 		 408 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  26.9 
 
 		 585 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  35.8 
 
 		 412 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  24.07 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  35.8 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  38.46 
 
 		 402 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  32.91 
 
 		 409 aa  45.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  35.9 
 
 		 407 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  31.5 
 
 		 213 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  30.26 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  36.59 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0190  hypothetical protein  31.62 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479373  normal  0.406587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  31.93 
 
 		 634 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0184  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.937664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  31.94 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  38 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  35.8 
 
 		 409 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  37.25 
 
 		 415 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.89 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  31.17 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.35 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  32.14 
 
 		 474 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  40.3 
 
 		 397 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.53 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  40 
 
 		 380 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0226  hypothetical protein  32.11 
 
 		 214 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  26.15 
 
 		 636 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>