More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6360 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6360  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
323 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398361  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5294  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  95.98 
 
 
323 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0831912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3808  alcohol dehydrogenase  69.04 
 
 
323 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5053  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  68.52 
 
 
324 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3022  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.34 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0720259  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2020  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2150  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.64 
 
 
322 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3434  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
322 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0491212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3096  putative NADPH quinone oxidoreductase  41.88 
 
 
322 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.751832  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5959  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.69 
 
 
327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  40.62 
 
 
336 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  38.58 
 
 
332 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.31 
 
 
332 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  39.5 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  40.44 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  37.97 
 
 
332 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
332 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  38.05 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  40.13 
 
 
338 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 
332 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  38.61 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.61 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  38.49 
 
 
356 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.94 
 
 
332 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.99 
 
 
326 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4208  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.69 
 
 
326 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4084  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.62 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.91 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  36.99 
 
 
338 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  35.33 
 
 
328 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.83 
 
 
332 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.14 
 
 
328 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 
327 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.22 
 
 
335 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.99 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.58 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  36.54 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.51 
 
 
369 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0411  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.75 
 
 
329 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201425  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.53 
 
 
342 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5173  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.89 
 
 
329 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3311  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.25 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  37.15 
 
 
341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.33 
 
 
336 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0935  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.51 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000152642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  35.86 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.55 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.33 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.6 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  37.22 
 
 
335 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.68 
 
 
328 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
344 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.95 
 
 
326 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  36.51 
 
 
325 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.64 
 
 
331 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.95 
 
 
334 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  34.02 
 
 
336 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2736  alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 
328 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00823064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.33 
 
 
334 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2807  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37 
 
 
333 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3909  alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 
331 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0317152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  37.11 
 
 
327 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.97 
 
 
324 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  34.91 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.44 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  37.62 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  35.02 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.02 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.6 
 
 
325 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3282  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 
333 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  38 
 
 
326 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.92 
 
 
332 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 
334 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  35.69 
 
 
337 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.27 
 
 
328 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.18 
 
 
333 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4023  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
345 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.961336  unclonable  0.000000000225765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.7 
 
 
343 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4930  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
327 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0640  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.95 
 
 
332 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  37.42 
 
 
327 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.97 
 
 
334 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
353 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 
325 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
329 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.51 
 
 
328 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1088  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.2 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  35.18 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  34.83 
 
 
328 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  36.28 
 
 
337 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0541  alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 
332 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0658  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.6 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  35.14 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.1 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0913  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.85 
 
 
328 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0131994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3411  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
332 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0690188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3731  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  35.18 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>