16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5544 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  100 
 
 		 916 aa  1821    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  63.65 
 
 		 935 aa  1016    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  34.76 
 
 		 887 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  37.85 
 
 		 1241 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1120 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  31 
 
 		 935 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  29.78 
 
 		 680 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  26.75 
 
 		 809 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  27.44 
 
 		 913 aa  99  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  28.12 
 
 		 877 aa  98.2  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  31.77 
 
 		 713 aa  78.2  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  29.01 
 
 		 945 aa  75.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  24.24 
 
 		 869 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  24.76 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  26.07 
 
 		 960 aa  55.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  32.97 
 
 		 468 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>