40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1031 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1031  transmembrane protein  100 
 
 		 192 aa  357  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0995  hypothetical protein  72.57 
 
 		 204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0244119  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  62.9 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  61.29 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2655  hypothetical protein  67.03 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  32.58 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  34.32 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  33.54 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  26.49 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  31.79 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  32.54 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  32.9 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  29.94 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  33.55 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  31.33 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  32.12 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  30.77 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  32.67 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3518  hypothetical protein  34.51 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  36.88 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  34.03 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3691  hypothetical protein  33.13 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0241  hypothetical protein  35.21 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  30.46 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  30.21 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  29.93 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  25.25 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  34.74 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  24.49 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  37.35 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  32.28 
 
 		 183 aa  42  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  24.49 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  24.49 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  23.81 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  23.81 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>