25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3121 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  100 
 
 
792 aa  1607    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  84.66 
 
 
769 aa  1290    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  50.83 
 
 
758 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  43.74 
 
 
773 aa  601  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  49.55 
 
 
760 aa  598  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2975  peptidase domain protein  44.6 
 
 
484 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  49.13 
 
 
891 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  47.91 
 
 
576 aa  253  9.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  44.56 
 
 
629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  46.62 
 
 
618 aa  231  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  47.96 
 
 
709 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  46.35 
 
 
710 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  43.35 
 
 
717 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  41.45 
 
 
620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  41.89 
 
 
289 aa  195  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  40.91 
 
 
289 aa  188  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  40.22 
 
 
510 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  32 
 
 
492 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.23 
 
 
689 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  31.54 
 
 
281 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  27.72 
 
 
421 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.67 
 
 
688 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  32.26 
 
 
354 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  33.01 
 
 
5899 aa  44.3  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  30.53 
 
 
350 aa  44.3  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>