More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3065 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3065  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
500 aa  1028    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.713679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2413  FAD dependent oxidoreductase  77.8 
 
 
500 aa  827    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0853  flavin-binding family monooxygenase  57.2 
 
 
527 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3682  FAD dependent oxidoreductase  58.75 
 
 
493 aa  621  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63888  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1538  FAD-dependent oxidoreductase  59.46 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1075  monooxygenase flavin-binding family protein  59.46 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0403  arylesterase/monoxygenase  59.67 
 
 
532 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  57.73 
 
 
486 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2821  arylesterase/monoxygenase  59.46 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0119  FAD-dependent oxidoreductase  59.46 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2674  FAD-dependent oxidoreductase  59.46 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1261  FAD-dependent oxidoreductase  59.04 
 
 
532 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0100  hypothetical protein  59.25 
 
 
532 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0445  FAD dependent oxidoreductase  58.26 
 
 
516 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.899914  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1071  FAD dependent oxidoreductase  59.41 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  59.21 
 
 
485 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  57.85 
 
 
516 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5044  FAD dependent oxidoreductase  59.38 
 
 
520 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.156233  normal  0.611983 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4698  FAD dependent oxidoreductase  58.59 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3568  FAD dependent oxidoreductase  58.75 
 
 
520 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310917  hitchhiker  0.00379062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3664  FAD dependent oxidoreductase  58.59 
 
 
530 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427417  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3857  FAD dependent oxidoreductase  58.39 
 
 
530 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.416953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5412  FAD dependent oxidoreductase  58.54 
 
 
520 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2103  FAD dependent oxidoreductase  58.09 
 
 
505 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0291228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2444  K+ transport flavoprotein  58.13 
 
 
524 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1012  cyclohexanone monooxygenase  55.62 
 
 
505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4935  cyclohexanone monooxygenase  57.35 
 
 
509 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  55.78 
 
 
497 aa  574  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1481  flavin-binding family monooxygenase  55.65 
 
 
500 aa  571  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0344357  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  52.37 
 
 
491 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  53.94 
 
 
495 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2545  FAD dependent oxidoreductase  55.85 
 
 
494 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000454873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  53.03 
 
 
491 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48680  hypothetical protein  53.44 
 
 
499 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.495007  hitchhiker  0.000481845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4170  hypothetical protein  52.19 
 
 
499 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2397  FAD dependent oxidoreductase  54 
 
 
494 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6459  flavin binding monooxygenase  51.36 
 
 
510 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5251  normal  0.105992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  51.97 
 
 
494 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4569  FAD dependent oxidoreductase  53.11 
 
 
479 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1543  FAD dependent oxidoreductase  53.06 
 
 
489 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00915558  normal  0.0198569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13890  monooxygenase ethA  53.61 
 
 
498 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1842  monooxygenase flavin-binding family protein  52.03 
 
 
522 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418098  normal  0.080497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2638  FAD dependent oxidoreductase  53.12 
 
 
477 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.753344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5228  putative monooxygenase (flavin-binding family)  51.57 
 
 
509 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5155  flavin-containing monooxygenase FMO  51.15 
 
 
506 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  50.52 
 
 
489 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 
489 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3830  cyclohexanone monooxygenase  50.73 
 
 
508 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  50.31 
 
 
489 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6845  flavin-containing monooxygenase FMO  49.38 
 
 
508 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5628  putative monooxygenase  50.85 
 
 
494 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4462  flavin-containing monooxygenase FMO  49.16 
 
 
508 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3670  FAD dependent oxidoreductase  50.52 
 
 
504 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.483411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13100  monooxygenase  48.25 
 
 
495 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2206  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 
493 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2805  monooxygenase flavin-binding family protein  48.06 
 
 
508 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2358  FAD dependent oxidoreductase  50.62 
 
 
498 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00284909  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0840  flavin-containing monooxygenase FMO  47.31 
 
 
507 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3870  putative monooxygenase  48.85 
 
 
499 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01354  putative aromatic-ring hydroxylase  47.13 
 
 
491 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0072  flavin-containing monooxygenase FMO  47.38 
 
 
510 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0715  monooxygenase flavin-binding family protein  44.76 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1683  FAD dependent oxidoreductase  44.03 
 
 
513 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  46.38 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  45.13 
 
 
486 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427859 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08898  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02570)  46.56 
 
 
486 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1582  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
494 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1558  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
494 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.898255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1528  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 
494 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.240611  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  44.61 
 
 
502 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  45.8 
 
 
500 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 
503 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1867  FAD dependent oxidoreductase  46.04 
 
 
509 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.379734  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  44.02 
 
 
510 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4499  FAD dependent oxidoreductase  44.91 
 
 
509 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0521039  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2342  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  43.4 
 
 
544 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3782  putative monooxygenase  43.83 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6776  flavin-containing monooxygenase FMO  44.68 
 
 
496 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2891  putative monooxygenase  45.47 
 
 
503 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.532899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4028  flavin-containing monooxygenase FMO  43.42 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  44.89 
 
 
505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2290  flavin-containing monooxygenase FMO  41.05 
 
 
540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.229134 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  41.46 
 
 
514 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01877  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  30.17 
 
 
570 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326089  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  27.97 
 
 
505 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  27.73 
 
 
488 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  28.54 
 
 
650 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.62 
 
 
816 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6279  flavin-containing monooxygenase FMO  29.75 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2048  flavin-containing monooxygenase FMO  26.65 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.18 
 
 
818 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.54 
 
 
816 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.79 
 
 
816 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13950  predicted flavoprotein involved in K+ transport  28.8 
 
 
505 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  29.66 
 
 
479 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
642 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
642 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  27.66 
 
 
565 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2885  putative flavin-binding monooxygenase  30.13 
 
 
489 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  27.75 
 
 
816 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>