29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3173 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3173  putative bacteriophage-related protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2273  hypothetical protein  57.23 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.647833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2632  hypothetical protein  56.16 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1399  putative bacteriophage-related protein  51.25 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2088  hypothetical protein  32.52 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.217793  normal  0.0481295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1124  hypothetical protein  31.54 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2927  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2778  hypothetical protein  29.01 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1942  putative bacteriophage-related protein  36.63 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3172  putative bacteriophage-related protein  47.62 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2633  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein, truncation  37.5 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3248  putative bacteriophage-related protein  45.16 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.767846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2834  hypothetical protein  32.2 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0584139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2274  hypothetical protein  36.27 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2763  hypothetical protein  36.96 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498341 
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  28.68 
 
 		 500 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2618  hypothetical protein  31.91 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000782229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2669  hypothetical protein  31.91 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1226  putative bacteriophage-related protein  29.37 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.856752  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2858  hypothetical protein  31.91 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.817778  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1950  putative phage-related protein  28.71 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3231  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0897  LacI family regulatory protein  27.82 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.238169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3775  putative phage-related protein  27.42 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1936  putative phage-related protein  27.42 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.46577  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  27.48 
 
 		 489 aa  44.3  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2796  hypothetical protein  42.11 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0892  putative phage-related protein  27.68 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>