22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0609 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  100 
 
 		 305 aa  634    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  37.16 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  37.16 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3435  hypothetical protein  36.05 
 
 		 321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  36.19 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  36 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  30.57 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0418  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000826848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  27.86 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  26.37 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  29.26 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  29.26 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  28.31 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  28.31 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  28.31 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  21.47 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  21.38 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  24.16 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  22.56 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  21.55 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  22.37 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>