47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0111 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0111  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 75 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0761015  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3320  sulfur carrier protein ThiS  86.67 
 
 		 71 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3644  sulfur carrier protein ThiS  86.67 
 
 		 71 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.68 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.68 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.33 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.21 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.32 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  42.47 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  41.1 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  41.1 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  42.47 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.21 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  39.73 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  38.36 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  38.36 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  39.19 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0894  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.88 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0249295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0207  sulfur carrier protein ThiS  47.95 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  39.73 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.51 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2432  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.84 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.660547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0164  sulfur carrier protein ThiS  63.64 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  32 
 
 		 73 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.88 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  34.25 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  30.14 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  30.14 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.25 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.38 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  30.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  32.88 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.49 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  30.14 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.88 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>