More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2106 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0782  cell division protein FtsW  100 
 
 
388 aa  767    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.18598  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2106  cell division protein FtsW  100 
 
 
388 aa  767    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0692  cell division protein FtsW  96.65 
 
 
388 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0681  cell division protein FtsW  75 
 
 
389 aa  592  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2424  putative cell division protein ftsW  70.1 
 
 
388 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0439759  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4496  cell division protein FtsW  74.29 
 
 
389 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2761  cell cycle protein  65.72 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.355007  normal  0.882367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2892  cell division protein  47.28 
 
 
384 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  44.74 
 
 
385 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  44.74 
 
 
385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  44.47 
 
 
386 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2420  cell division protein FtsW  46.83 
 
 
382 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.737508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2079  cell division protein FtsW  43.72 
 
 
375 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0540467  normal  0.263887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1190  cell division protein FtsW  47.4 
 
 
399 aa  285  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0951  cell cycle protein  43.05 
 
 
392 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0948  cell division protein FtsW  40.97 
 
 
386 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104281  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2008  cell division protein FtsW  43.21 
 
 
384 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0298176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2083  cell division protein FtsW  42.89 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  hitchhiker  0.00100012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4049  cell division protein FtsW  43.53 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1993  cell cycle protein  43.28 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.273485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6175  essential cell division protein (stabilizes FtsZ ring)  44.14 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3667  cell division protein FtsW  41.37 
 
 
390 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249047  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2595  cell division protein FtsW  42.36 
 
 
384 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1278  cell cycle protein  42.78 
 
 
382 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.959004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3395  cell cycle protein  42.47 
 
 
381 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2855  cell division protein FtsW  42.36 
 
 
384 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3171  cell cycle protein  39.79 
 
 
387 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.0069748  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3307  cell cycle protein  43.67 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1050  cell cycle protein  42.25 
 
 
383 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00180763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3167  cell cycle protein  40.22 
 
 
388 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0456428  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2940  cell cycle protein  40.22 
 
 
388 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3486  cell cycle protein  41.87 
 
 
398 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2357  cell cycle protein  40.49 
 
 
388 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3123  cell cycle protein  39.95 
 
 
388 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7444  cell cycle protein  41.85 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0691  cell cycle protein  39.47 
 
 
380 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145993  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6705  cell cycle protein  40.76 
 
 
379 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0062  cell cycle protein  40.99 
 
 
387 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1882  cell cycle protein  39.2 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3948  cell cycle protein  37.84 
 
 
405 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1132  cell cycle protein  39.84 
 
 
397 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.91568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0754  cell division protein FtsW  36.65 
 
 
375 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.138938  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0394  cell division protein FtsW, putative  31.64 
 
 
371 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.612635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0957  cell division protein FtsW  35.1 
 
 
394 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.343907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  34.52 
 
 
368 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  32.1 
 
 
393 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.25 
 
 
368 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.7 
 
 
367 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  33.42 
 
 
375 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  32.87 
 
 
539 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.61 
 
 
378 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1041  cell cycle protein FtsW  34.63 
 
 
372 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.6 
 
 
363 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  32.83 
 
 
417 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.84 
 
 
368 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2495  cell cycle protein  33.07 
 
 
386 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  33.99 
 
 
417 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  33.06 
 
 
369 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0567  cell cycle protein  33.07 
 
 
389 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.62 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  34.97 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  32.63 
 
 
380 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1146  cell division protein FtsW  31.75 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  33.98 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2092  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2607  cell division protein FtsW  33.07 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  33.06 
 
 
509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  32.24 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  30.22 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  33.15 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.04 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  32.68 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  30.52 
 
 
391 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  30.52 
 
 
391 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  30.87 
 
 
380 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0768  cell division protein FtsW  35.48 
 
 
400 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.626093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  33.43 
 
 
404 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  32.53 
 
 
423 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0177  cell cycle protein  30.96 
 
 
402 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.186002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  31.36 
 
 
543 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2194  cell division protein FtsW  34.72 
 
 
401 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.689364  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  31.54 
 
 
368 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  32.8 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  29.95 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  32.01 
 
 
368 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0449  cell division protein FtsW  34.35 
 
 
415 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3064  cell division protein FtsW  29.53 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  31.28 
 
 
398 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0896  cell division protein FtsW  31.38 
 
 
476 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.560244  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0601  cell division protein FtsW  31.69 
 
 
441 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  31.52 
 
 
364 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.89 
 
 
359 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  30.09 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.1 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4513  cell division protein FtsW  33.23 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444721  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  31.91 
 
 
380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.43 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  31.4 
 
 
368 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  32.61 
 
 
383 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>