38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1544 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  100 
 
 		 329 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  98.18 
 
 		 329 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  84.42 
 
 		 332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  49.4 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  44.07 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  47.59 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  27.74 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  26.52 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  31.34 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  29.97 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  27.83 
 
 		 377 aa  93.2  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  30.18 
 
 		 374 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  29.41 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  28.82 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  29.59 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  27.76 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  27.68 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  26.59 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  27.46 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  27.46 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  28.75 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  28.27 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  27.16 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  27.33 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  28.13 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  26.03 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.88 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  24.38 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  27.22 
 
 		 425 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  28.48 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  24.36 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  26.34 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  23.89 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  22.66 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>