116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1503 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  48.08 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  43.52 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2806  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  48.51 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.22176  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  44.23 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0070  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.46 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  39.05 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0879  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.83 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.168693 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0713  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  45.45 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1379  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  41.41 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.52 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.52 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.78 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  36.7 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3057  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.67 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.46 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.83 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0485  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  35.42 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231758  normal  0.0484471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0258  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.01 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1127  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.78 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.13 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.13 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.25 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.04 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1183  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.31 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.726417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.57 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  32.04 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1483  hypothetical protein  41.03 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  29.25 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.32 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2610  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.74 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  32.32 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0697  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.06 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1036  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  42.31 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2523  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.83 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.449226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.36 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  37 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  31.18 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1172  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.18 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.18 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  34 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0968  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  39.24 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.4173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.36 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05695  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04120)  32.69 
 
 		 336 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.11 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3548  hypothetical protein  29.81 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4073  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.48 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.45 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  38.46 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0714  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  39.24 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0942  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.81 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.583327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3882  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.1 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1761  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.82 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.161913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0743  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.39 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0297  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.17 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.42 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0736  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.59 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3641  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.34 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.051183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2618  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.88 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4314  hypothetical protein  26.17 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0707  hypothetical protein  26.55 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2637  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  38.46 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.302583  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.73 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.08 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0221  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.11 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.79 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.42 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2351  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.77 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  32.69 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.58 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.36 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0631  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463993  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4864  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.05 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.83 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.21 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.21 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  27.62 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1553  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.23 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0715  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.9 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3260  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.34 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0590  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.67 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2315  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.53 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.08295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  23.36 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2237  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.71 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  28.85 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2665  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.34 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4001  hypothetical protein  32.04 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4239  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.97 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3537  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 154 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  0.188367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>