94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02981 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS02981  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  300  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.553777  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0244  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 
147 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6566  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
142 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2877  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6122  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0209  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4620  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6298  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.708322  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5712  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1818  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.148545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  35.34 
 
 
299 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2311  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
299 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0575757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
147 aa  67  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3824  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114693  normal  0.354709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6012  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2343  arsenate reductase  35.4 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5968  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1412  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.320001  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.20692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5348  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.692382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  33.85 
 
 
196 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6009  cytoplasmic peptidoglycan synthetase domain protein  30.22 
 
 
631 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9151  N-acetylglutamate synthase and related acetyltransferase-like protein  33.67 
 
 
195 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5124  hypothetical protein  23.57 
 
 
152 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3584  N-acetylglutamate synthase  30.28 
 
 
439 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  26.71 
 
 
150 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5065  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2062  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8374  N-acetylglutamate synthase  29.32 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25180  N-acetylglutamate synthase  30.95 
 
 
189 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0111  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4479  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0253  acetyltransferase  30.83 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1344  amino-acid N-acetyltransferase  32.32 
 
 
440 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5503  hypothetical protein  21.43 
 
 
152 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109359  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3847  hypothetical protein  22.14 
 
 
152 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000188919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3990  N-acetylglutamate synthase  32.63 
 
 
161 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266966  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  29.92 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0596  N-acetylglutamate synthase  29.55 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0558798  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5419  N-acetylglutamate synthase  28.97 
 
 
432 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1675  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  24.44 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0587  acetyltransferase  23.48 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0836  N-acetylglutamate synthase  25.74 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0586  hypothetical protein  32.18 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5949  N-acetylglutamate synthase  30.48 
 
 
432 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1774  GCN5-related N-acetyltransferase  29.9 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68740  N-acetylglutamate synthase  30.48 
 
 
432 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  25.98 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5801  N-acetylglutamate synthase  28.33 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2325  acetyltransferase  25 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000933187  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4989  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1262  N-acetylglutamate synthase  28.68 
 
 
454 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0481247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0723  amino-acid acetyltransferase  27.83 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2443  acetyltransferase  25 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.034532  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0688  N-acetylglutamate synthase  27.94 
 
 
454 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.127329  normal  0.447208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0324  N-acetylglutamate synthase  28.04 
 
 
448 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0254  N-acetylglutamate synthase  28.04 
 
 
432 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0234  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.149769  normal  0.204982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  28.15 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2168  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121288  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12760  N-acetylglutamate synthase  27.94 
 
 
174 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.246029  normal  0.121736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0893  N-acetylglutamate synthase  28.12 
 
 
170 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.038377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2122  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2109  N-acetylglutamate synthase  31.25 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0656379 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1774  acetyltransferase  25.2 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000016365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0946  acetyltransferase  22.6 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601769  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2284  acetyltransferase  26.53 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.786273  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1184  acetyltransferase  26.04 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  22.76 
 
 
626 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0278  N-acetylglutamate synthase  27.27 
 
 
432 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3557  N-acetylglutamate synthase  27.68 
 
 
435 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0561  hypothetical protein  29.89 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2646  acetyltransferase  23.62 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000217972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2295  amino-acid N-acetyltransferase  26.53 
 
 
456 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0223326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5245  N-acetylglutamate synthase  28.04 
 
 
432 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.987249  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1870  acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5092  N-acetylglutamate synthase  28.04 
 
 
432 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5185  N-acetylglutamate synthase  28.04 
 
 
432 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610315  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
136 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>