More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4111 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4111  inositol-1(or 4)-monophosphatase  100 
 
 		 271 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1853  inositol-1(or 4)-monophosphatase  86.9 
 
 		 253 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0604801  decreased coverage  0.000548461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1347  inositol monophosphatase  78.2 
 
 		 271 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4707  inositol monophosphatase  77.86 
 
 		 270 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.977346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3181  inositol monophosphatase  69.96 
 
 		 271 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.717976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2559  inositol monophosphatase  69.57 
 
 		 275 aa  345  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1688  putative inositol monophosphatase family protein  68.44 
 
 		 248 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.719108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1485  inositol monophosphatase  52.26 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0855  inositol monophosphatase  48.36 
 
 		 272 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0786662  normal  0.150631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0895  inositol monophosphatase  47.95 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.632992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0821  inositol monophosphatase  47.13 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0630  inositol-phosphate phosphatase  46.8 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2248  inositol monophosphatase  45.67 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5380  inositol monophosphatase  45.23 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0361  inositol monophosphatase  45.28 
 
 		 270 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0915  inositol monophosphatase  45.38 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3043  inositol monophosphatase  43.46 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0422  inositol monophosphatase  44.17 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0530  inositol monophosphatase  43.14 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.428745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0070  inositol monophosphatase  45.96 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0486  inositol monophosphatase  42.58 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0479273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0902  inositol monophosphatase family protein  44.4 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0192  inositol monophosphatase family protein  42.44 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0212  inositol monophosphatase family protein  42.02 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4535  inositol-phosphate phosphatase  41.94 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0435  inositol monophosphatase  41.83 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0063  inositol-phosphate phosphatase  39.06 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695366  hitchhiker  0.0000489388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2640  inositol monophosphatase  38.58 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.727914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3283  inositol monophosphatase  38.84 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0917  inositol monophosphatase  39.09 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.018726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3002  inositol-phosphate phosphatase  38.4 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.867462  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2576  inositol monophosphatase  38.27 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0568  inositol monophosphatase  37.35 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2360  inositol monophosphatase  43.26 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3171  inositol monophosphatase  36.08 
 
 		 258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0402  inositol-1(or 4)-monophosphatase  35.5 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2688  inositol monophosphatase  38.11 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0024  inositol monophosphatase  31.52 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0795  inositol monophosphatase  36.41 
 
 		 402 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2288  inositol monophosphatase  34.69 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.690009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.11 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.11 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.62 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.11 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03972  3-Phosphoadenosine 5-phosphosulfate (PAPS) 3-phosphatase  32.17 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00312866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0225  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.48 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4086  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.8 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  35.85 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.8 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.8 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.8 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1698  inositol monophosphatase  36.55 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.133457  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1912  inositol monophosphatase  30.29 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2747  Inositol-phosphate phosphatase  36.59 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.24 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0173  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate (PAPS) 3'-phosphatase-like  31.68 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00388  inositol-1-monophosphatase  37.72 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  32.24 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  31.25 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  33.62 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.36 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1636  extragenic supressor  39.49 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1579  inositol-phosphate phosphatase  39.49 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0271512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.78 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.42 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0184  cysQ protein  32.08 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.39498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.42 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  33.62 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3950  inositol monophosphatase  37.93 
 
 		 570 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.176149  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1199  inositol-phosphate phosphatase  34.07 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.339227 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  31.09 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.46 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2303  inositol monophosphatase  30.7 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000171915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0186  inositol-phosphate phosphatase  32.37 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1058  inositol monophosphatase  30 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0425  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  31.36 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2169  inositol monophosphatase family protein  34.89 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0841  inositol monophosphatase  34.89 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2324  inositol-phosphate phosphatase  35.17 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.33 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1174  inositol-phosphate phosphatase  29.47 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  34.35 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.99 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  30.04 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1985  inositol monophosphatase  29.05 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.838762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  34.04 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38679  predicted protein  33.95 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0394  inositol monophosphatase  30.6 
 
 		 607 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0603  Inositol-phosphate phosphatase  31.53 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  33.06 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  29.63 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  31.9 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  36.77 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4536  inositol-phosphate phosphatase  32.33 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.403288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2471  inositol monophosphatase  31.23 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  29.65 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  32.3 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  32.38 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>