26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3869 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  87.5 
 
 		 129 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  60.77 
 
 		 130 aa  167  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  71.54 
 
 		 130 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3878  hypothetical protein  48.85 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.716332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  35.54 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  32.84 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  37.21 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  31.45 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  31.34 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1689  protein of unknown function DUF1469  32.79 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  32.2 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1552  hypothetical protein  32.23 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.67 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1831  protein of unknown function DUF1469  31.97 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  25 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3142  hypothetical protein  36.29 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  27.41 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.08 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  29.55 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7553  protein of unknown function DUF1469  33.33 
 
 		 131 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0520584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  30.25 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>