19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3391 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  87.11 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  76.45 
 
 		 273 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  68.73 
 
 		 274 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  43.5 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  36.44 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  36.44 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  38.87 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  33.06 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  31.91 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  27 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  30.58 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  27 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  25.66 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  29.21 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.08 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.37 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  27.18 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  21.79 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>