23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1954 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  79.59 
 
 		 581 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  100 
 
 		 673 aa  1365    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  37.23 
 
 		 965 aa  262  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 922 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  32.14 
 
 		 756 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  30.35 
 
 		 692 aa  201  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  30.83 
 
 		 932 aa  157  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 793 aa  135  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  27.64 
 
 		 523 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 813 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 363 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4861  hypothetical protein  22.51 
 
 		 920 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.74 
 
 		 810 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 612 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 739 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  31.31 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 472 aa  44.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 632 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.22 
 
 		 603 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 681 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 		 551 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 583 aa  43.9  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>