More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4453 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  83.96 
 
 
106 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  81.13 
 
 
106 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  80.19 
 
 
106 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.49 
 
 
107 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.66 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.72 
 
 
106 aa  123  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.72 
 
 
106 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  53.33 
 
 
110 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  52.83 
 
 
107 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  52.38 
 
 
107 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
106 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  51.43 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
106 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
106 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.08 
 
 
127 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
105 aa  100  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  44.44 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  42.86 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
116 aa  94  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  40.95 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  40.95 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  42.59 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
118 aa  92  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  40.95 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  41.12 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  41.9 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  40.38 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.14 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
121 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
133 aa  90.5  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
120 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
109 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
121 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.19 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
206 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  39.42 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  43.81 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  40.38 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.54 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
111 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
130 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  41.35 
 
 
119 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.68 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  40.38 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  44.23 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
115 aa  85.9  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0445  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.09 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.361267  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  48.91 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  40.38 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  40.38 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  39.42 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  40.38 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0886  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.95 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62045  normal  0.0717209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.42 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>