19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3281 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3281  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  48.89 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  53.33 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  47.19 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  44.59 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  39.56 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  36.26 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  37.14 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  38.57 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  35.16 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  42.47 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  52.78 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  34.41 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  39.53 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  45 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.1 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  43.18 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>