35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3782 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  83.46 
 
 		 255 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  73.23 
 
 		 254 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  69.77 
 
 		 255 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  62.96 
 
 		 266 aa  314  9e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  63.08 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  60.66 
 
 		 267 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3250  hypothetical protein  42.74 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3052  hypothetical protein  42.15 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3276  hypothetical protein  42.15 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  44.79 
 
 		 295 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  47.3 
 
 		 310 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2566  hypothetical protein  47.69 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0818  hypothetical protein  46.81 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0307205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  35.56 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  31.33 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1942  FlaA locus 229 kDa protein  33.08 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3427  hypothetical protein  28.46 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0467043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2950  hypothetical protein  31.29 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.283763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  24.78 
 
 		 169 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  26.21 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  26.87 
 
 		 164 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  27.73 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  30.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  26.83 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3261  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  21.9 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1315  hypothetical protein  28.35 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2975  hypothetical protein  28.35 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.701427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  23.62 
 
 		 169 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2008  hypothetical protein  27.45 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2748  hypothetical protein  32.81 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0697  hypothetical protein  22.81 
 
 		 439 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.261572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>