268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3359 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
277 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000932469  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3588  phenazine biosynthesis family protein  87 
 
 
277 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0126  PhzF family phenazine biosynthesis protein  61.4 
 
 
276 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0113  PhzF family phenazine biosynthesis protein  61.76 
 
 
276 aa  315  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0838  putative phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.73 
 
 
259 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.08 
 
 
301 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.5 
 
 
278 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1315  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.69 
 
 
280 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2519  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.21 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.08 
 
 
281 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2922  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.32 
 
 
306 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.78 
 
 
305 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.64 
 
 
287 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.82 
 
 
314 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0549  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.67 
 
 
275 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2885  phenazine biosynthesis protein PhzF family  37.67 
 
 
309 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0846454  normal  0.375181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.04 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.25 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.33 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.12 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.12 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.05 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.51 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.6 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.63 
 
 
299 aa  82  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  27.62 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.11 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6290  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.85 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.434232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.03 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.47 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.64 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.41 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.15 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.960271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.36 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.56 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2880  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.4 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000112609  hitchhiker  0.000294886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.82 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.82 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.32 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1777  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.54 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.798377  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  23.67 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  23.67 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09420  phenazine biosynthesis protein  29.56 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39890  phenazine biosynthesis protein  29.56 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.45 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.04 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0884  phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3380  phenazine biosynthesis protein  29.93 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.37 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0966  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.87 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  27.16 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  25.91 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  25.55 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.45 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.45 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  29.27 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.33 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.47 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.59 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.55 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.55 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.85 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  25.55 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.62 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.45 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.45 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  23.81 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.16 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  38.89 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.82 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  30.04 
 
 
297 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  28.22 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.49 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  33.99 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.98 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.34 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3194  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.83 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.515626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1823  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  25.53 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.683249  normal  0.0823956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.74 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.28 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  28.46 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.28 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.52 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.01 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.75 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  28.46 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3421  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  24.73 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  26.61 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.87 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.36 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.01 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  25.64 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  29.66 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2745  uncharacterized isomerase  30.11 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0223122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.35 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3108  hypothetical protein  30.33 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  32.31 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>